В состав клиники "Аллергомед" входят 7 отделений:

Аллергологическое взрослое отделение, специализирующееся на обследовании и лечении аллергологических пациентов в возрасте от 16 лет и старше.

Аллергологическое детское отделение, пациентами которого являются дети в возрасте от рождения до 16 лет. Врачи аллергологи отделения все по первичной специализации – педиатры.

Поликлиническое взрослое отделение, специализирующееся на обследовании и лечении пациентов в возрасте от 16 лет и старше.

Поликлиническое детское отделение, пациентами которого являются дети в возрасте от рождения до 16 лет.

Дерматологическое отделение (или отделение косметологии), его целью является диагностика и лечение  аллергических заболеваний кожи.

Психотерапевтическое отделение, где оказывается помощь пациентам с аллергологической патологией, а так же всем тем, кто страдает невротическими расстройствами и  другими (неаллергическими) психосоматическими заболеваниями.

Отделение нелекарственных методов лечения, воплощающее концепцию профессора Федосеева Г.Б. о лечении аллергологических заболеваний через системный подход к воздействию на организм аллергика с помощью различных нелекарственных методов.