С 1985 года на кафедре госпитальной терапии 1 Ленинградского Медицинского Института (1ЛМИ) им. акад. И.П.Павлова, возглавляемой профессором Глебом Борисовичем  Федосеевым, особенно бурно начали формироваться международные связи в исследованиях, направленных на изучение методов нелекарственного лечения аллергических заболеваний. К этому времени был накоплен большой опыт работы сотрудников кафедры по изучению влияния иглорефлексотерапии, гомеопатии, психотерапии, разгрузочно-диетической терапии (РДТ), лечебной физкультуры на течение  бронхиальной астмы, поллиноза, атопического дерматита, крапивницы и на другие формы аллергической патологии.

В период перестройки наши ученые уже могли обмениваться собственным опытом со специалистами других стран. В то время впервые многие методы лечения появились в нашей стране  в формах близких к первоисточникам. Например, до перестройки знали  иглорефлексотерапию, но практически  не преподавали  для наших специалистов  принципы классической китайской  медицины; а  из психотерапии  знали только две- три методики.    В эти годы возникли контакты с Китайской Народной Республикой, чьи врачи работали на кафедре и защищали кандидатские и докторские диссертации.  В это же время китайские специалисты обучали российских  врачей Отделения психотерапии и иглотерапии 1ЛМИ им. акад.И.П. Павлова методам Классической Китайской Медицины. Это обучение продолжалось пять лет, что почти соответствует классическому медицинскому образованию.

Врачи психотерапевты кафедры госпитальной терапии обучались ведущими специалистами Германии, США, Канады и Индии. Конец 80х годов прошлого столетия ознаменовался появлением большого количества  новых методов психотерапии в нашей стране.  Сотрудники  кафедры сами разрабатывали  и изучали  эффективность методов психотерапевтического лечения.  Были защищены три диссертационные работы по изучению  формирования нервно-психического механизма бронхиальной астмы, а так же  методам психотерапевтического лечения.

В области гомеопатии происходило сотрудничество с французской школой гомеопатии. Врачи  Госпитальной терапии проходили обучение во Франции, в то же время защищали диссертационные работы на кафедре.  

Это бурное развитие методов немедикаментозного лечения и понимание необходимости комплексного лечения больных с аллергологической патологией привело к идее создания МЦ «Аллергомед». Профессором Федосеевым Г.Б. в ходе многочисленных научных исследований была сформулирована основная концепция адекватного лечения аллергии и астмы, основывающаяся на комплексном подходе, включающем вместе с лекарственной терапией еще и  нелекарственные методы. Этот подход к лечению был затруднителен на кафедре по целому  ряду причин. Во-первых, срок наблюдения за такими пациентами и возможность лечения был слишком мал в условиях  клиники, из-за фиксированного времени пребывания в стационаре (21 койко-день), тогда как для удержания пациентов в стойкой ремиссии необходимы годы профилактического лечения; во-вторых, штатным расписанием клиники не предусмотрено наличие таких специалистов, как остеопат, гомеопат, диетолог; в- третьих, клиника госпитальной терапии оказывает помощь только взрослому населению, поэтому дети не могли быть охвачены комплексным лечением.

Четко сформулированная концепция, штат хорошо подготовленных специалистов и команда единомышленников – все это дало возможность организовать медицинский центр, где необходимо было воплотить в жизнь научные представления член-корр РАМН, профессора   Г.Б. Федосеева.   

МЦ «Аллергомед» начал свою работу в октябре 2002 года, тогда появился его первый филиал на ул. Достоевского дом 18.  С первых недель существования центра началась активная работа с врачами различных специальностей, причастных к лечению аллергологической  патологии, по разъяснению принципов стратегической и тактической терапии для  больных с бронхиальной астмой, атопическим дерматитом, круглогодичным аллергическим ринитом, крапивницей. Были проведены встречи с районными врачами-аллергологами, опубликованы статьи в «Санкт-Петербургских врачебных ведомостях».  После первого года работы была проведена конференция для врачей терапевтов районных поликлиник  и аллергологов по обсуждению результатов комплексного лечения больных в МЦ «Аллергомед». Ежегодно в «Аллергомеде»  подводятся итоги количественной и качественной оценки лечения пациентов.  Неоднократно достижения в лечении больных были обсуждены на ежегодных Конгрессах терапевтов Северо-Западного региона.

С 2005 года «Аллергомед» начал  проводить  общегородские клинические разборы для врачей различных специальностей в рамках заседаний Общества терапевтов им. С.П. Боткина,  где представляются пациенты с тяжелыми формами аллергической патологии, которым была оказана эффективная помощь. Эти разборы проводит член. корр. РАМН, главный аллерголог города, профессор Г.Б. Федосеев.  

В 2004 открылся второй филиал «Аллергомеда» на ул. Бармалеева  дом 12.    В  октябре  2006 года МЦ «Аллергомед» был переименован в Клинику профессора Федосеева «Аллергомед».

В ноябре 2008 года был открыт филиал по адресу Кузнечный пер. дом 2. В связи с расширением площадей и централизацией всей медицинской помощи, было принято решение о ликвидации филиала на ул Бармалеева, дом 12.

С 24 декабря 2012 года в связи со значительным расширением масштабов деятельности, клиника Аллергомед работает на Московском проспекте, дом 109.